добрый дикий мир

Чтобы вырезать 3-х минутный кусок из видео начиная с 15-ой минуты нужно набрать:

ffmpeg -vcodec copy -acodec copy -i input.webm -ss 00:15:00 -t 00:03:00 output.webm

Порядок опций важен, иначе может получиться мусор на выходе. Форматы входного и выходного файлов должны быть одинаковы. Посмотреть кодеки файла можно командой ffprobe.

Большая часть советов про ffmpeg в сети неадекватны. За редким исключением.

upd. В новой версии ffmpeg 2.0 чуть по другому:
ffmpeg -i input.webm -vcodec copy -acodec copy -ss 00:15:00 -t 00:03:00 output.webm

upd2. Чтобы вырезать аудио из видео:
сначала посмотреть на формат аудио командой ffprobe
Потом (для Vorbis):
ffmpeg -i input.webm -map 0:1 -c:a copy output.ogg
или
ffmpeg -i input.webm -vn -acodec copy output.ogg
Для mp3 - ставить расширение mp3, и т.д.
Скрипт для обработки множества файлов:

#!/bin/sh
for i in *.webm
do
k=`echo ${i}.ogg`
echo "${i}"
echo ${k}
ffmpeg -i "${i}" -vn -acodec copy ${k} ;
done

как убрать пробелы в именах файлов

upd3. Видео для плеера iriver e200

ffmpeg -i video.mp4 -s 320x240 -vcodec libxvid video.avi