paroh | Исследователи опубликовали результаты о потенциальных новых методах лечения лейшманиоза

Автор: д-р Карлос Мускус Лопес
Координатор отдела молекулярной биологии и вычислительного блока, университета PECET, Антиокия
8 сентября 2016

Кратко:
Команда Drug Search for Leishmaniasis (поиск лекарства для лейшманиоза) недавно опубликовала свои выводы в журнале Computer-Aided Molecular Design. Используя вычислительную мощность World Community Grid, они выявили несколько лекарственных соединений, которые могут привести к улучшению методов лечения этой запущенной, а иногда и смертельной болезни.

Один из лучших лигандов, связанных с dihydrorootate дегидрогеназой (DHODH) из Leishmania major. (а) Предсказанное связывание внутри кристаллической структуры (б) Совмещение структур лиганда, теоретически связывающихся с каждым из структуры белков DHODH, извлеченных при моделировании методом молекулярной динамики.

Исходные данные

Лейшманиоз, одна из самых игнорируемых тропических болезней в мире, заражает каждый год более двух миллионов человек. Заболевание вызывается паразитами (род Leishmania), который передается от человека к человеку и животным женскими москитами. Число случаев продолжает расти в тропических странах, таких как Бангладеш, Индия, Судан, Эфиопия, Бразилия, Колумбия, Перу и других.

Существующие способы лечения лейшманиоза могут вызвать серьезные побочные эффекты. Кроме того, устойчивые к лекарствам паразиты вызывают серьезные проблемы во многих странах. По этим причинам, существует острая необходимость в новых, безопасных и недорогих лекарственных соединениях против лейшманиоза.

Общее представление

В нашей работе мы описываем подробные шаги, которые мы сделали, чтобы определить цели белкового лекарственного средства, которые включали скрининг 600000 молекул, чтобы определить, что может привести к разработке новых методов лечения заболевания. В частности, мы искали лекарства, нацеленные на белки, необходимые для выживания паразита, вызывающего лейшманиоз. Обнаружив молекулы, связывающиеся с белками, их потенциально можно отключить, тем самым остановить инфекцию и вылечить заболевание.

В статье описывается, как некоторые из белковых мишеней могут изгибаться и изменять форму, что представляет некоторые трудности в поиске хороших молекул-кандидатов. Мы обсуждаем наш подход к решению этих проблем.

Используя результаты, вычисленные на World Community Grid, мы выбрали десять лучших лекарств-кандидатов для проведения экспериментов в пробирке, которые дали очень обнадеживающие результаты. В частности, одно из соединений, по-видимому, способно убить паразита лейшманиоза, не влияя на клетки человека в лабораторных условиях. Три дополнительных соединения также показали обнадеживающие результаты.

Сейчас мы планируем работать, чтобы изменить три найденных перспективных лекарственных соединения для улучшения их потенциальных возможностей, растворимости и сведения к минимуму токсичности. Мы также будем оценивать и другие топ-кандидаты в зависимости от средств, которые мы сможем раздобыть. Кроме того, мы разрабатываем открытую платформу данных с результатами World Community Grid так, чтобы другие исследователи могли просматривать наши данные для обнаружения дополнительных хитов лекарств или ориентиров.

Вы можете прочитать краткое изложение статьи здесь. Мы признательны всем добровольцам World Community Grid, которые сделали это исследование возможным, жертвуя их вычислительную мощность для этого проекта.

новость на англ.