![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
parohАвтор: Д-р Carolina Horta Andrade
Федеральный университет де Гояс, Бразилия
19 мая 2016
Кратко:
Вирус Зика был относительно неизвестным до 2015 года, когда он сделал заголовки из-за его быстрого распространения и его связи с серьезными недостатками мозга у младенцев, рожденных от матерей, заразившимися вирусом во время беременности. Доктор Carolina Horta Andrade, главный исследователь нового проекта OpenZika, обсуждает как она и международная команда исследователей используют World Community Grid для ускорения поиска эффективного лекарства анти-Зика.
Доктор Carolina Horta Andrade, главный исследователь OpenZika
Введение
Мало кто слышал о вируса Зика до 2015 года, когда он начал быстро распространяться в Северной и Южной Америке, особенно в Бразилии. Основное распространение вируса - жёлтолихорадочными комарами, хотя сексуальное и передачей крови также возможны. В текущий момент неизвестен процент беременных женщин, заразившихся вирусом Zika и родивших детей с состоянием, названным микроцефалией, что приводит к серьезным проблемам развития мозга. В других случаях, взрослые и дети, заразившиеся вирусом Zika получили паралич и другие неврологические проблемы.
В настоящее время не существует лечения для вируса Зика и вакцина отсутствует. Учитывая, что Зика быстро стал международной проблемой общественного здравоохранения, я и моя команда работаем с исследователями здесь, в Бразилии, а также в Соединенных Штатах, чтобы искать возможности лечения, и мы используем World Community Grid для ускорения нашего проекта.
Объяснение
Мир становится все более встревожен вирусом Зика и с полным основанием. До недавнего времени было мало исследований по этой болезни, но в последние несколько месяцев они были связаны с серьезными недостатками головного мозга у некоторых детей, а также потенциальными неврологическими проблемами у детей и взрослых. Как ученый и гражданин Бразилии, которые сильно затронуты Зика, я намерена бороться с вирусом, но я и моя команда будет нуждаться в помощи волонтеров World Community Grid, чтобы обеспечить массовую вычислительную мощность, необходимую для нашего поиска лечения Зика.
Я профессор Федерального университета Гояс (УМЗ) в Бразилии, а также директор LabMol, университетской лаборатории, которая ищет лечение забытых болезней и рака. Мое поле - лекарственная и вычислительная химия с акцентом на разработке лекарственных препаратов и обнаружения забытых болезней. Впервые я заинтересовалась работой в этой области, потому что это болезни, которые не интересуют фармацевтические компании, так как они в основном влияют на маргинальные группы населения в слаборазвитых и развивающихся странах. Тем не менее, эти заболевания являются крайне изнурительными и для большинства из них не существует адекватного лечения препаратами. Бразилия является уязвимой к ряду забытых болезней, таких как лихорадка денге, малярия, лейшманиоз, шистосомоз и другие. Мое самое большое желание - найти лекарства, чтобы улучшить жизнь тысяч людей по всему миру, которые страдают от этих заболеваний.
В 2015 году я начала проект в сотрудничестве с доктором Шоном Экинсом, фармакологом с большим опытом научных исследований, чтобы сосредоточиться на разработке расчетных моделей для выявления активных соединений против вируса денге, которая является серьезным переносимым комарами заболеванием, встречающимся по всему миру. Эти активные соединения могут стать кандидатами для противовирусных препаратов. Сейчас мы находимся на стадии выбора соединений для запуска лабораторных испытаний. В январе 2016 года, когда вспышка вируса Зика в Бразилии стала тревожной, Шон и я решили расширить наше исследование денге и мы включили вирус Зика в нашу работу, так как эти два заболевания из того же семейства вирусов.
Шон пригласил меня и других сотрудников, чтобы написать детализированный документ, который был опубликован в начале 2016 года, о необходимости открытого исследования лекарственного средства для вируса Зика. Эта работа привлекла внимание научного иллюстратора Джона Либлера, который хотел сделать картину полного вириона Зика. Мы используем рисунок им созданный как иллюстративный элемент для проекта OpenZika.
Интерес Джона вдохновил нас попытаться смоделировать каждый белок у вируса Зика, что непосредственно привело к написанию прогрессивной статьи с гомологическими моделями всех белков вируса Зика. (Гомологические модели, которые являются вычислительными трехмерными визуализациями белков в организме, могут быть использованы когда структура белка экспериментально не известна, что и в случае с вирусом Зика.)
Исследовательская группа OpenZika
После этого Шон и я начали работу над вирусом Зика, он познакомил меня с World Community Grid. Шон также сотрудничал с д-ром Александром Перриманом из Университета Рутгерса, медицинской школы Нью-Джерси, который был ранее в научно-исследовательском институте Скриппса, где он играл ключевую роль в двух проектах World Community Grid: Fight AIDS@Home и GO Fight Against Malaria. Шон и Алекс оба соисследователи со мной по проекту OpenZika.
Исследовательская группа также включает в себя моих коллег по UFG, Dr. Rodolpho Braga, Dr. Melina Mottin and Dr. Roosevelt Silva; Dr. Jair L. Siqueira-Neto из Калифорнийского университета в Сан-Диего; и Dr. Wim Degrave из Фонда Освальдо Круза в Бразилии, который уже работает с World Community Grid в проекте Uncovering Genome Mysteries, наряду с прочими.
Эта большая группа сотрудников означает, что команда имеет все наборы навыков и опыта, необходимых для проведения этого исследования от начала до конца, так как некоторые из исследователей являются экспертами компьютерного моделирования в то время, как другие имеют обширный лабораторный опыт.
Наши цели
Проект OpenZika на World Community Grid направлен на выявление кандидатов препарата для лечения вируса Зика у людей, которые были инфицированы. Проект будет использовать программное обеспечение для скрининга миллионов химических соединений против белков-мишеней, что вирус Зика вероятно использует для выживания и распространения в организме человека, на основании того, что известно из подобных заболеваний, таких как вирус лихорадки денге и желтой лихорадки. Поскольку научное знание о вирусе Зика выросло в ближайшие месяцы и ключевые белки идентифицированы, команда OpenZika будет использовать новые знания для совершенствования нашего поиска.
Наша работа по World Community Grid является лишь первым шагом в более крупном проекте открытия нового препарата для борьбы с вирусом Зика. Далее мы будем анализировать данные, полученные от виртуального скрининга World Community Grid, чтобы выбрать соединения, которые показывают наибольшую перспективу. После того как мы выберем и протестируем соединения, которые могут быть эффективными в убийстве вируса Зика, мы будем публиковать наши результаты. Как только мы докажем, что некоторые из соединений-кандидатов могут на самом деле убить или отключить вирус в клеточных тестах, мы и другие лаборатории сможем тогда модифицировать молекулы для повышения их эффективности против вируса, обеспечивая при этом, что эти модифицированные соединения являются безопасными и нетоксичными.
Мы полны решимости опубликовать все результаты для общественности, как только они будут завершены, так что другие ученые могут помочь продвинуть развитие некоторых из этих активных соединений в новых лекарствах. Мы надеемся, что OpenZika будет включать в себя второй этап, на котором мы можем выполнять виртуальные скрининги на многих других соединениях.
Без этого исследования - и другие проекты, которые изучают вирус Зика - это заболевание может стать еще большей угрозой в связи с быстрым распространением вируса комарами, кровью и передачи инфекции половым путем. Связь между вирусом Зика у беременных женщин и тяжелыми заболеваниями мозга у детей может повлиять на поколение с большим чем обычно количеством людей, имеющих серьезные неврологические трудности.
И без ресурсов World Community Grid, используя только ресурсы нашей лаборатории, мы бы были только в состоянии отскринить несколько тысяч соединений против некоторых из белков Зика, или это заняло бы годы, чтобы скринить миллионы соединений против всех белков Зика. Это может серьезно ограничить наш потенциал для открытия новых лекарств.
Привлечение на свою сторону добровольцев World Community Grid позволит вычислительно оценить более 20-ти миллионов соединений только на начальном этапе (и, возможно, до 90 миллионов соединений на последующих этапах). Таким образом, запуск проекта OpenZika на World Community Grid позволит значительно расширить масштабы нашего проекта, и это увеличит скорость, с которой мы можем получить результаты к приближению появления противовирусного препарата для вируса Зика.
Работая вместе и делясь нашей работой с научным сообществом, многие другие исследователи в мире также будет иметь возможность рассматривать перспективные молекулярные кандидатов заранее, чтобы ускорить прогресс на пути победы над вспышкой Зика.
новость на англ.
Федеральный университет де Гояс, Бразилия
19 мая 2016
Кратко:
Вирус Зика был относительно неизвестным до 2015 года, когда он сделал заголовки из-за его быстрого распространения и его связи с серьезными недостатками мозга у младенцев, рожденных от матерей, заразившимися вирусом во время беременности. Доктор Carolina Horta Andrade, главный исследователь нового проекта OpenZika, обсуждает как она и международная команда исследователей используют World Community Grid для ускорения поиска эффективного лекарства анти-Зика.
Доктор Carolina Horta Andrade, главный исследователь OpenZika
Введение
Мало кто слышал о вируса Зика до 2015 года, когда он начал быстро распространяться в Северной и Южной Америке, особенно в Бразилии. Основное распространение вируса - жёлтолихорадочными комарами, хотя сексуальное и передачей крови также возможны. В текущий момент неизвестен процент беременных женщин, заразившихся вирусом Zika и родивших детей с состоянием, названным микроцефалией, что приводит к серьезным проблемам развития мозга. В других случаях, взрослые и дети, заразившиеся вирусом Zika получили паралич и другие неврологические проблемы.
В настоящее время не существует лечения для вируса Зика и вакцина отсутствует. Учитывая, что Зика быстро стал международной проблемой общественного здравоохранения, я и моя команда работаем с исследователями здесь, в Бразилии, а также в Соединенных Штатах, чтобы искать возможности лечения, и мы используем World Community Grid для ускорения нашего проекта.
Объяснение
Мир становится все более встревожен вирусом Зика и с полным основанием. До недавнего времени было мало исследований по этой болезни, но в последние несколько месяцев они были связаны с серьезными недостатками головного мозга у некоторых детей, а также потенциальными неврологическими проблемами у детей и взрослых. Как ученый и гражданин Бразилии, которые сильно затронуты Зика, я намерена бороться с вирусом, но я и моя команда будет нуждаться в помощи волонтеров World Community Grid, чтобы обеспечить массовую вычислительную мощность, необходимую для нашего поиска лечения Зика.
Я профессор Федерального университета Гояс (УМЗ) в Бразилии, а также директор LabMol, университетской лаборатории, которая ищет лечение забытых болезней и рака. Мое поле - лекарственная и вычислительная химия с акцентом на разработке лекарственных препаратов и обнаружения забытых болезней. Впервые я заинтересовалась работой в этой области, потому что это болезни, которые не интересуют фармацевтические компании, так как они в основном влияют на маргинальные группы населения в слаборазвитых и развивающихся странах. Тем не менее, эти заболевания являются крайне изнурительными и для большинства из них не существует адекватного лечения препаратами. Бразилия является уязвимой к ряду забытых болезней, таких как лихорадка денге, малярия, лейшманиоз, шистосомоз и другие. Мое самое большое желание - найти лекарства, чтобы улучшить жизнь тысяч людей по всему миру, которые страдают от этих заболеваний.
В 2015 году я начала проект в сотрудничестве с доктором Шоном Экинсом, фармакологом с большим опытом научных исследований, чтобы сосредоточиться на разработке расчетных моделей для выявления активных соединений против вируса денге, которая является серьезным переносимым комарами заболеванием, встречающимся по всему миру. Эти активные соединения могут стать кандидатами для противовирусных препаратов. Сейчас мы находимся на стадии выбора соединений для запуска лабораторных испытаний. В январе 2016 года, когда вспышка вируса Зика в Бразилии стала тревожной, Шон и я решили расширить наше исследование денге и мы включили вирус Зика в нашу работу, так как эти два заболевания из того же семейства вирусов.
Шон пригласил меня и других сотрудников, чтобы написать детализированный документ, который был опубликован в начале 2016 года, о необходимости открытого исследования лекарственного средства для вируса Зика. Эта работа привлекла внимание научного иллюстратора Джона Либлера, который хотел сделать картину полного вириона Зика. Мы используем рисунок им созданный как иллюстративный элемент для проекта OpenZika.
Интерес Джона вдохновил нас попытаться смоделировать каждый белок у вируса Зика, что непосредственно привело к написанию прогрессивной статьи с гомологическими моделями всех белков вируса Зика. (Гомологические модели, которые являются вычислительными трехмерными визуализациями белков в организме, могут быть использованы когда структура белка экспериментально не известна, что и в случае с вирусом Зика.)
Исследовательская группа OpenZika
После этого Шон и я начали работу над вирусом Зика, он познакомил меня с World Community Grid. Шон также сотрудничал с д-ром Александром Перриманом из Университета Рутгерса, медицинской школы Нью-Джерси, который был ранее в научно-исследовательском институте Скриппса, где он играл ключевую роль в двух проектах World Community Grid: Fight AIDS@Home и GO Fight Against Malaria. Шон и Алекс оба соисследователи со мной по проекту OpenZika.
Исследовательская группа также включает в себя моих коллег по UFG, Dr. Rodolpho Braga, Dr. Melina Mottin and Dr. Roosevelt Silva; Dr. Jair L. Siqueira-Neto из Калифорнийского университета в Сан-Диего; и Dr. Wim Degrave из Фонда Освальдо Круза в Бразилии, который уже работает с World Community Grid в проекте Uncovering Genome Mysteries, наряду с прочими.
Эта большая группа сотрудников означает, что команда имеет все наборы навыков и опыта, необходимых для проведения этого исследования от начала до конца, так как некоторые из исследователей являются экспертами компьютерного моделирования в то время, как другие имеют обширный лабораторный опыт.
Наши цели
Проект OpenZika на World Community Grid направлен на выявление кандидатов препарата для лечения вируса Зика у людей, которые были инфицированы. Проект будет использовать программное обеспечение для скрининга миллионов химических соединений против белков-мишеней, что вирус Зика вероятно использует для выживания и распространения в организме человека, на основании того, что известно из подобных заболеваний, таких как вирус лихорадки денге и желтой лихорадки. Поскольку научное знание о вирусе Зика выросло в ближайшие месяцы и ключевые белки идентифицированы, команда OpenZika будет использовать новые знания для совершенствования нашего поиска.
Наша работа по World Community Grid является лишь первым шагом в более крупном проекте открытия нового препарата для борьбы с вирусом Зика. Далее мы будем анализировать данные, полученные от виртуального скрининга World Community Grid, чтобы выбрать соединения, которые показывают наибольшую перспективу. После того как мы выберем и протестируем соединения, которые могут быть эффективными в убийстве вируса Зика, мы будем публиковать наши результаты. Как только мы докажем, что некоторые из соединений-кандидатов могут на самом деле убить или отключить вирус в клеточных тестах, мы и другие лаборатории сможем тогда модифицировать молекулы для повышения их эффективности против вируса, обеспечивая при этом, что эти модифицированные соединения являются безопасными и нетоксичными.
Мы полны решимости опубликовать все результаты для общественности, как только они будут завершены, так что другие ученые могут помочь продвинуть развитие некоторых из этих активных соединений в новых лекарствах. Мы надеемся, что OpenZika будет включать в себя второй этап, на котором мы можем выполнять виртуальные скрининги на многих других соединениях.
Без этого исследования - и другие проекты, которые изучают вирус Зика - это заболевание может стать еще большей угрозой в связи с быстрым распространением вируса комарами, кровью и передачи инфекции половым путем. Связь между вирусом Зика у беременных женщин и тяжелыми заболеваниями мозга у детей может повлиять на поколение с большим чем обычно количеством людей, имеющих серьезные неврологические трудности.
И без ресурсов World Community Grid, используя только ресурсы нашей лаборатории, мы бы были только в состоянии отскринить несколько тысяч соединений против некоторых из белков Зика, или это заняло бы годы, чтобы скринить миллионы соединений против всех белков Зика. Это может серьезно ограничить наш потенциал для открытия новых лекарств.
Привлечение на свою сторону добровольцев World Community Grid позволит вычислительно оценить более 20-ти миллионов соединений только на начальном этапе (и, возможно, до 90 миллионов соединений на последующих этапах). Таким образом, запуск проекта OpenZika на World Community Grid позволит значительно расширить масштабы нашего проекта, и это увеличит скорость, с которой мы можем получить результаты к приближению появления противовирусного препарата для вируса Зика.
Работая вместе и делясь нашей работой с научным сообществом, многие другие исследователи в мире также будет иметь возможность рассматривать перспективные молекулярные кандидатов заранее, чтобы ускорить прогресс на пути победы над вспышкой Зика.
новость на англ.
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
«Куда вас сударь в х…я занесло? Неужто…»
Date: 2016-05-21 02:49 pm (UTC)Неужто…»
Уважаемый артиллерист.
Просматривая, что в ЖЖ есть по теме этой новой инфекции из преисподней, случайно наткнулся на вас и ваш материал.
Прошу прощения, что сразу не ругаюсь матом, но вот сижу над вашей страницей и никак не могу второпаты!
На кой х… В общем, известный половой орган моего соседа вонючего козла?
Уважаемый артиллерист тут поместил эту… В общем, производную от полового органа вонючего козла?
И я бы так и пребывал в неведении, если бы не прочитал вот это от вас себя любимого – «Если Вы вдруг сюда зашли, подумайте хорошенько, нужно ли тратить время на чтение этой ерунды? Не лучше ли почитать классиков?»
К сожалению, я это увидел слишком поздно…
Да и классиков я уже даже и не помню, когда читал.
Хотя вот тут через клятый склероз вылезло!
Прямо и сам удивился!
Что вот, считай недавно!
Читал КЛАССИКА!!
По имени Джек Лондон!
А конкретнее его мистическую дьявольскую «АЛУЮ ЧУМУ»…
Но в этом классике покончившего с собой так и осталось «НЕВЫЯСНЕННЫМ»!
Когда описанное им, как говорится, МАТЕРИАЛИЗУЕТСЯ???
В том, что называется Америкация?
И дойдёт ли это до просторов когда-то великого и могучего?
Перед этим, правда, превратив в ЖЁЛТУЮ ПУСТЫНЮ то, что сегодня величают «великим Китаем».
На самом деле деланном, бутафорном колоссе на глиняных ногах!!!
Не знаю, помните ли и вы то время, когда «великий и могучий» тоже величали таким вот «колоссом на глиняных ногах»???!!!
И как с этого известная пропаганда и известные структуры только что не фекалили и не мочились в прямых и непрямых «эфирах»!!!
А оказалось, что и» великий и могучий» таки тоже был таким же деланным, бутафорным колоссом на глиняных ногах!
Каким на сегодня является этот «великий Китай» с его мудрым политбюро.
И с этим увы, не поспоришь.
Даааа.
Крепкую вы уважаемый артиллерист разместили у себя ху..ню на постном масле.
Крепкую…
С уважением. Доктор. Харьков.
Re: «Куда вас сударь в х…я занесло? Неужто…»
Date: 2016-05-21 03:05 pm (UTC)