![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
paroh"Автор: Вим Degrave, к.т.н.
Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática Instituto Oswaldo Cruz - Fiocruz
14 октября 2015
Резюме
Проект "Раскрытие загадок генома" уже собрал данные о более чем 200 млн белков, с целью понимания общих особенностей жизни всюду на земле. Есть десятки миллионы вычислений для запуска, но команда также готовится к анализу и последующей публикации данных.
В течение почти года теперь, раскрывая тайны генома сравнивал белковые последовательности, полученные из геномов почти всех живых организмов анализируемых на сегодняшний день. Благодаря волонтерам, жертвующим компьютерное время для World Community Grid, более 34 миллионов результатов были возвращены с данными о функциональной идентификации и белковых сходствах. Вместе с нашими сотрудниками в Австралии, мы уделили особое внимание микроорганизмам из различных экосистем, с особым акцентом на морские организмы. Более 200 миллионов белков были сравнены до сих пор, в процессе эквивалента 15000 лет вычислений. Полученные данные отправляются на наши серверы компьютер в ФОК Фонд в Рио-де-Жанейро, Бразилия, а теперь и в Университете Нового Южного Уэльса, Сидней, Австралия. И последний комплект, около 20 млн белковых последовательностей, установленный в течение последнего года, в настоящее время добавляется в набор данных и будет работать на World Community Grid в ближайшие месяцы.
Тем не менее, задача функционального отображения и сравнения между белками из всех этих организмов не заканчивается. Наша команда ученых, в то же время, инвестирует больше усилий для оптимизации алгоритмов для дальнейшего анализа и представления данных, полученных с помощью добровольцев World Community Grid, и готовит систему баз данных, которая сделает результаты доступными для научного сообщества. После того, как наши данные станут общественными, мы ожидаем, что понимание научного сообщества из сложной сети жизни получит полностью новую перспективу и что результаты будут также способствовать развитию многих новых приложений в области здравоохранения, сельского хозяйства и наук о жизни в целом.
Этот проект является результатом сотрудничества между World Community Grid, в лаборатории д-ра Торстена Томаса и его команды из школы биотехнологии и биомолекулярных наук и центра морских био-инноваций в университете Нового Южного Уэльса, Сидней, Австралия, и нашей команде в лаборатории функциональной геномики и биоинформатики, на Освальдо Круз фонда - ФОК, в Бразилии."
Оригинал (англ.)
Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática Instituto Oswaldo Cruz - Fiocruz
14 октября 2015
Резюме
Проект "Раскрытие загадок генома" уже собрал данные о более чем 200 млн белков, с целью понимания общих особенностей жизни всюду на земле. Есть десятки миллионы вычислений для запуска, но команда также готовится к анализу и последующей публикации данных.
В течение почти года теперь, раскрывая тайны генома сравнивал белковые последовательности, полученные из геномов почти всех живых организмов анализируемых на сегодняшний день. Благодаря волонтерам, жертвующим компьютерное время для World Community Grid, более 34 миллионов результатов были возвращены с данными о функциональной идентификации и белковых сходствах. Вместе с нашими сотрудниками в Австралии, мы уделили особое внимание микроорганизмам из различных экосистем, с особым акцентом на морские организмы. Более 200 миллионов белков были сравнены до сих пор, в процессе эквивалента 15000 лет вычислений. Полученные данные отправляются на наши серверы компьютер в ФОК Фонд в Рио-де-Жанейро, Бразилия, а теперь и в Университете Нового Южного Уэльса, Сидней, Австралия. И последний комплект, около 20 млн белковых последовательностей, установленный в течение последнего года, в настоящее время добавляется в набор данных и будет работать на World Community Grid в ближайшие месяцы.
Тем не менее, задача функционального отображения и сравнения между белками из всех этих организмов не заканчивается. Наша команда ученых, в то же время, инвестирует больше усилий для оптимизации алгоритмов для дальнейшего анализа и представления данных, полученных с помощью добровольцев World Community Grid, и готовит систему баз данных, которая сделает результаты доступными для научного сообщества. После того, как наши данные станут общественными, мы ожидаем, что понимание научного сообщества из сложной сети жизни получит полностью новую перспективу и что результаты будут также способствовать развитию многих новых приложений в области здравоохранения, сельского хозяйства и наук о жизни в целом.
Этот проект является результатом сотрудничества между World Community Grid, в лаборатории д-ра Торстена Томаса и его команды из школы биотехнологии и биомолекулярных наук и центра морских био-инноваций в университете Нового Южного Уэльса, Сидней, Австралия, и нашей команде в лаборатории функциональной геномики и биоинформатики, на Освальдо Круз фонда - ФОК, в Бразилии."
Оригинал (англ.)
