![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
VID-19
Девин Колдевей,techcrunch / 22:32 + 03 • 10 сентября 2020 г.
Сегодня фонд Breakthrough Prize Foundation объявил о присуждении премии в размере 21,75 миллиона долларов за различные научные достижения. Одним из них, в частности, является кроссовер науки и техники: премия в 3 миллиона долларов Дэвиду Бейкеру, работа которого за последние 20 лет помогла подтвердить идею о том, что компьютеры могут помочь нам понять и создать сложные молекулы, такие как белки, - а последняя такая молекула может привести к новым методам лечения COVID-19.
Бейкер является главой Института дизайна белков Вашингтонского университета и на протяжении двух десятилетий помогает исследовать и определять поле компьютерной молекулярной биологии. Его лаборатория разработала программное обеспечение Rosetta для моделирования чрезвычайно сложного сворачивания и других взаимодействий белков, а также распределенную вычислительную сеть FoldIT для распространения задачи среди активных гражданских ученых.
Как говорит Бейкер: «Мы могли бы подождать еще миллион лет, пока не появится необходимый нам белок, или мы могли бы разработать его сами».
Премия специально присуждается «За разработку технологии, которая позволила создать белки, никогда ранее не встречавшиеся в природе, включая новые белки, которые могут быть использованы для лечения заболеваний человека». Это свидетельствует о признании роли Бейкера и его коллег в технологии в целом, но его последняя работа может оказаться наиболее значимой: это сделанная на заказ молекула, созданная специально для подавления острых всплесков нового коронавируса.
Это молекулярный эквивалент надевания ножен на меч. Единственная проблема в том, что у меча нет ножен - его нужно сделать самому. И это намного сложнее, чем кажется, поскольку существует множество факторов, влияющих на то, как аминокислоты, атомы и связи взаимодействуют между ними. К счастью, это именно та проблема, для которую Бейкер и его команда создали платформу для решения.
Красная молекула - это мини-связка, прикрепленная к синему белку коронавируса.
«Мы разработали общие методы дизайна для создания белков с нуля, которые по форме и химическим свойствам дополняют произвольные целевые участки», - сказал Бейкер TechCrunch. «Мы просто указали на вирусный спайк!»
Белки "de novo", созданные и протестированные командой, прочно связываются со спайковым белком и не отпускают его - отсюда их название - «гиперстабильные мини-связки». Это не чудодейственное лекарство, но это может стать началом терапевтического подхода, который отключает способ распространения вируса - разумеется, после того, как он будет должным образом протестирован.
«Разработанный белок, описанный в опубликованной сегодня статье Science, выглядит очень многообещающим, - сказал Бейкер. «Мы проводим доклинические эксперименты, чтобы определить, может ли это быть эффективным лекарством в том виде, в каком он есть, или его необходимо модифицировать».
Он также отметил, что «игроки FoldIT и участники Rosetta@home внесли важный вклад в наши усилия по борьбе с COVID», так что отличная работа, если вы пожертвовали компьютерные циклы проекту.
Вы можете увидеть множество других призов, присужденных в этом году по таким темам, как математика и фундаментальная физика, в новостной публикации фонда здесь.
Фонд «Премия прорыва» изначально был создан благодаря усилиям (и денежным сундукам) Юрия и Джулии Мильнер, а премию в области наук о жизни спонсируют Сергей Брин, Присцилла Чан и Марк Цукерберг, Пони Ма и Энн Войчицки.
на англ.
Девин Колдевей,techcrunch / 22:32 + 03 • 10 сентября 2020 г.
Сегодня фонд Breakthrough Prize Foundation объявил о присуждении премии в размере 21,75 миллиона долларов за различные научные достижения. Одним из них, в частности, является кроссовер науки и техники: премия в 3 миллиона долларов Дэвиду Бейкеру, работа которого за последние 20 лет помогла подтвердить идею о том, что компьютеры могут помочь нам понять и создать сложные молекулы, такие как белки, - а последняя такая молекула может привести к новым методам лечения COVID-19.
Бейкер является главой Института дизайна белков Вашингтонского университета и на протяжении двух десятилетий помогает исследовать и определять поле компьютерной молекулярной биологии. Его лаборатория разработала программное обеспечение Rosetta для моделирования чрезвычайно сложного сворачивания и других взаимодействий белков, а также распределенную вычислительную сеть FoldIT для распространения задачи среди активных гражданских ученых.
Как говорит Бейкер: «Мы могли бы подождать еще миллион лет, пока не появится необходимый нам белок, или мы могли бы разработать его сами».
Премия специально присуждается «За разработку технологии, которая позволила создать белки, никогда ранее не встречавшиеся в природе, включая новые белки, которые могут быть использованы для лечения заболеваний человека». Это свидетельствует о признании роли Бейкера и его коллег в технологии в целом, но его последняя работа может оказаться наиболее значимой: это сделанная на заказ молекула, созданная специально для подавления острых всплесков нового коронавируса.
Это молекулярный эквивалент надевания ножен на меч. Единственная проблема в том, что у меча нет ножен - его нужно сделать самому. И это намного сложнее, чем кажется, поскольку существует множество факторов, влияющих на то, как аминокислоты, атомы и связи взаимодействуют между ними. К счастью, это именно та проблема, для которую Бейкер и его команда создали платформу для решения.
Красная молекула - это мини-связка, прикрепленная к синему белку коронавируса.
«Мы разработали общие методы дизайна для создания белков с нуля, которые по форме и химическим свойствам дополняют произвольные целевые участки», - сказал Бейкер TechCrunch. «Мы просто указали на вирусный спайк!»
Белки "de novo", созданные и протестированные командой, прочно связываются со спайковым белком и не отпускают его - отсюда их название - «гиперстабильные мини-связки». Это не чудодейственное лекарство, но это может стать началом терапевтического подхода, который отключает способ распространения вируса - разумеется, после того, как он будет должным образом протестирован.
«Разработанный белок, описанный в опубликованной сегодня статье Science, выглядит очень многообещающим, - сказал Бейкер. «Мы проводим доклинические эксперименты, чтобы определить, может ли это быть эффективным лекарством в том виде, в каком он есть, или его необходимо модифицировать».
Он также отметил, что «игроки FoldIT и участники Rosetta@home внесли важный вклад в наши усилия по борьбе с COVID», так что отличная работа, если вы пожертвовали компьютерные циклы проекту.
Вы можете увидеть множество других призов, присужденных в этом году по таким темам, как математика и фундаментальная физика, в новостной публикации фонда здесь.
Фонд «Премия прорыва» изначально был создан благодаря усилиям (и денежным сундукам) Юрия и Джулии Мильнер, а премию в области наук о жизни спонсируют Сергей Брин, Присцилла Чан и Марк Цукерберг, Пони Ма и Энн Войчицки.
на англ.
